云南農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院下設(shè)農(nóng)學(xué)與園藝技術(shù)學(xué)院、畜牧獸醫(yī)學(xué)院、食品藥品與大健康學(xué)院、工程學(xué)院、互聯(lián)網(wǎng)技術(shù)學(xué)院、經(jīng)濟(jì)管理學(xué)院、思想政治理論課教學(xué)科研部、公共基礎(chǔ)部和體育工作部共六院三部。
云南農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院現(xiàn)有教職工541人，其中教授29人、副教授106人，云嶺名師1人，占專任教師的54.22%；博士研究生7人、碩士研究生163人，占專任教師的68.27%；“雙師素質(zhì)”教師186人、占專任教師的74.70%，其中98位教師擁有農(nóng)業(yè)行業(yè)職業(yè)技能鑒定考評員資格，省級教學(xué)名師3名；省級以上教育教學(xué)改革成果101項，其中，國家級15項；國家專利107項，農(nóng)業(yè)農(nóng)村部申報新品種10項。獲省級以上表彰獎勵46項，其中科技進(jìn)步獎3項。
云南農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院開設(shè)專業(yè)49個，在籍學(xué)生10913人。其中，畜牧獸醫(yī)、園藝技術(shù)、工程造價3個專業(yè)被教育部認(rèn)定為國家級骨干專業(yè)，畜牧獸醫(yī)、園藝技術(shù)、工程造價、作物生產(chǎn)技術(shù)、中草藥栽培技術(shù)、農(nóng)產(chǎn)品加工與質(zhì)量檢測、財務(wù)管理7個專業(yè)為省級骨干專業(yè)。
云南農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院現(xiàn)有茭菱校區(qū)、小哨校區(qū)、馬龍校區(qū)(云南山地牧業(yè)科技示范園)，校園占地面積超過1萬畝。小哨校區(qū)擁有700余畝的實習(xí)農(nóng)牧場，馬龍校區(qū)擁有8000余畝的實訓(xùn)基地。目前，擁有校內(nèi)實訓(xùn)基地76個，實驗實訓(xùn)室126個，校外實訓(xùn)基地188個。