合肥醫(yī)藥類大學(xué)排名第一的是安徽醫(yī)科大學(xué)，排名第二的是安徽中醫(yī)藥大學(xué)，排名第三的是安徽醫(yī)科大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)院，以下是相關(guān)信息，供大家參考。
| 序號 | 名稱 | 主管部門 | 城市 | 公/民 |
| 1 | 安徽醫(yī)科大學(xué) | 安徽省 | 合肥 | 公辦 |
| 2 | 安徽中醫(yī)藥大學(xué) | 安徽省 | 合肥 | 公辦 |
| 3 | 安徽醫(yī)科大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)院 | 安徽省教育廳 | 合肥 | 民辦 |
安徽醫(yī)科大學(xué)
安徽醫(yī)科大學(xué)（Anhui Medical University）為安徽省屬重點大學(xué)，直屬安徽省人民政府，由安徽省人民政府、國家衛(wèi)生和計劃生育委員會、中華人民共和國教育部三方共同建設(shè)，入選中西部高?；A(chǔ)能力建設(shè)工程，成為安徽省高等教育振興計劃第一批“地方特色高水平大學(xué)建設(shè)”高校，教育部“卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計劃”試點高校。
學(xué)校前身是1926年5月創(chuàng)辦的上海東南醫(yī)學(xué)院。1949年底響應(yīng)中共中央華東局“面向農(nóng)村，走向內(nèi)地”的號召，內(nèi)遷安徽省，成為安徽省第一所高等醫(yī)科院校。1952年改名為安徽醫(yī)學(xué)院。1996年6月經(jīng)國家教委批準，更名為安徽醫(yī)科大學(xué)。
安徽中醫(yī)藥大學(xué)
安徽中醫(yī)藥大學(xué)（Anhui University of Chinese Medicine）坐落于安徽省合肥市，入選中西部高?；A(chǔ)能力（二期）建設(shè)項目，是安徽省高等教育振興計劃“地方特色高水平大學(xué)建設(shè)”高校、安徽省高峰學(xué)科建設(shè)計劃支持高校 。
安徽中醫(yī)藥大學(xué)創(chuàng)建于1959年，其前身為1952年創(chuàng)立的安徽省中醫(yī)進修班（學(xué)校）。1959年，安徽省政府正式批準成立安徽中醫(yī)學(xué)院。1970年，安徽中醫(yī)學(xué)院并入安徽醫(yī)學(xué)院。1975年，國家教育部批準恢復(fù)安徽中醫(yī)學(xué)院。2000年，安徽省醫(yī)藥學(xué)校并入安徽中醫(yī)學(xué)院。2011年，省政府批準在安徽中醫(yī)學(xué)院的基礎(chǔ)上組建成立安徽省中醫(yī)藥科學(xué)院。2013年，教育部同意安徽中醫(yī)學(xué)院更名為安徽中醫(yī)藥大學(xué)。
安徽醫(yī)科大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)院
安徽醫(yī)科大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)院是2003年由安徽醫(yī)科大學(xué)創(chuàng)建，是經(jīng)國家教育部和安徽省人民政府批準設(shè)立的獨立學(xué)院；是安徽省納入第二批本科錄取的全日制普通高等教育本科院校。
學(xué)院秉承安徽醫(yī)科大學(xué)90余年的文化傳統(tǒng)和辦學(xué)理念，堅持“以教學(xué)為中心，以學(xué)生為主體”的辦學(xué)宗旨，堅持“需求導(dǎo)向、錯位爭先、醫(yī)教協(xié)同、特色發(fā)展”的發(fā)展思路。2017年11月遵照教育部26號令要求，由安徽醫(yī)科大學(xué)與安徽新華集團投資有限公司合作舉辦，是按新機制和新模式運行的本科高校。2019年，獨立學(xué)院轉(zhuǎn)設(shè)納入教育部十三五規(guī)劃。 2021年3月，學(xué)院轉(zhuǎn)設(shè)方案經(jīng)省教育廳上報教育部審批。