在日本，醫(yī)學(xué)專業(yè)有9個分支，分別是：醫(yī)科學(xué)(基礎(chǔ)醫(yī)學(xué))、醫(yī)學(xué)(臨床醫(yī)學(xué))、和社會醫(yī)學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)和看護(hù)學(xué)、藥學(xué)、生物學(xué)、醫(yī)療福祉學(xué)。
1. 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)
本科6年，碩士2年，博士3年
研究人的生命和疾病現(xiàn)象的本質(zhì)及其規(guī)律的自然科學(xué)。其所研究的關(guān)于人體的健康與疾病的本質(zhì)及其規(guī)律為其他所有應(yīng)用醫(yī)學(xué)所遵循。
內(nèi)容包括：解剖學(xué)和組織學(xué)，生理學(xué)，病理學(xué)，疾病學(xué)，微生物學(xué)，生化學(xué)·營養(yǎng)學(xué)，藥理學(xué)，免疫學(xué)，遺傳學(xué)。神經(jīng)科學(xué)。放射生物學(xué)等。這些課程設(shè)置在日本的大學(xué)里面一般是設(shè)置在醫(yī)學(xué)研究科或者是藥學(xué)研究科里，除了這2個研究科之外，有時也會分布在在理學(xué)研究科和理工學(xué)研究科的生物學(xué)專攻下面。
2.臨床醫(yī)學(xué)
本科6年，博士4年
是一門實(shí)踐性很強(qiáng)的應(yīng)用科學(xué)專業(yè)。旨在培養(yǎng)具備基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)的基本理論和醫(yī)療預(yù)防的基本技能;能在醫(yī)療衛(wèi)生單位、醫(yī)學(xué)科研等部門從事醫(yī)療及預(yù)防、醫(yī)學(xué)科研等方面工作的醫(yī)學(xué)高級專門人才。
內(nèi)容包括：呼吸器內(nèi)科學(xué)、免疫代謝內(nèi)科學(xué)、消化器內(nèi)科學(xué)、循環(huán)病態(tài)內(nèi)科學(xué)、血液內(nèi)科學(xué)、健康管理醫(yī)學(xué)、放射線醫(yī)學(xué)、校醫(yī)學(xué)、放射線治療醫(yī)學(xué)、應(yīng)用分子畫像科學(xué)、放射性醫(yī)學(xué)綜合研究、消化器外科學(xué)、腎泌尿器外科學(xué)、循環(huán)器呼吸器外科學(xué)、乳腺外科學(xué)、麻醉醫(yī)學(xué)、急救醫(yī)學(xué)、整形外科學(xué)、體育醫(yī)學(xué)、復(fù)健醫(yī)學(xué)、兒科學(xué)、產(chǎn)科生殖醫(yī)學(xué)、生殖內(nèi)分泌學(xué)、皮膚科學(xué)、耳鼻咽喉科學(xué)、眼科學(xué)、精神醫(yī)學(xué)、腦神經(jīng)外科學(xué)、神經(jīng)內(nèi)科學(xué)、先進(jìn)醫(yī)療管理學(xué)等。
3.社會醫(yī)學(xué)
本科6年，碩士2年，博士3年
是從社會學(xué)角度研究醫(yī)學(xué)問題的一門學(xué)科，它研究社會因素對個體和群體健康、疾病的作用及其規(guī)律，制定各種社會措施，保護(hù)人們的身心健康和增加社會活動能力，提高生活質(zhì)量。
內(nèi)容包括：衛(wèi)生學(xué)·細(xì)胞預(yù)防醫(yī)學(xué)、公共衛(wèi)生學(xué)、法醫(yī)學(xué)、醫(yī)療政策評價學(xué)、醫(yī)療統(tǒng)計學(xué)、醫(yī)學(xué)教育·綜合診療醫(yī)學(xué)、醫(yī)藥品醫(yī)療器械評價學(xué)等。
4. 口腔醫(yī)學(xué)
本科6年，碩士2年，博士3年
在日本稱為齒學(xué)，旨在培養(yǎng)口腔鄂顏面的外傷、疾病的表現(xiàn)及原因分析，并且進(jìn)行預(yù)防、診斷和治療的醫(yī)師。
內(nèi)容包括：基礎(chǔ)齒學(xué)和臨床齒學(xué)。
5. 看護(hù)學(xué)
本科4年，碩士2年，博士3年
就是國內(nèi)的護(hù)理學(xué)。
內(nèi)容包括：基礎(chǔ)看護(hù)學(xué)、成人看護(hù)學(xué)、老人看護(hù)學(xué)、兒童看護(hù)學(xué)、女性看護(hù)學(xué)、助產(chǎn)學(xué)、精神看護(hù)學(xué)等。
6. 藥學(xué)
日本藥學(xué)一般分為2個學(xué)科：
(1)藥學(xué)科(本科4年，碩士2年，博士3年)：側(cè)重于藥理和藥的效用，旨在于培養(yǎng)藥學(xué)研究者。
(2)藥科學(xué)科(本科6年，博士4年)：側(cè)重于要的理論研究和新藥的研發(fā)，以培養(yǎng)藥劑師為目的。
內(nèi)容包括：分為基礎(chǔ)藥學(xué)和臨床藥學(xué)
7. 獸醫(yī)學(xué)
本科6年，博士4年
旨在培養(yǎng)動物進(jìn)行疾病預(yù)防、診斷病治療的醫(yī)生，大多設(shè)置在農(nóng)學(xué)分野。
內(nèi)容包括：基礎(chǔ)獸醫(yī)學(xué)和臨床獸醫(yī)學(xué)
8. 生物學(xué)
本科4年，碩士2年，博士3年
研究生命和生命有機(jī)體的自然科學(xué)，因?yàn)榕c醫(yī)學(xué)高度連結(jié)。故又衍生生物醫(yī)學(xué)科學(xué)，主要運(yùn)用生物學(xué)及工程技術(shù)手段研究和解決生命科學(xué)。
內(nèi)容包括：基礎(chǔ)生物學(xué)(動物學(xué)、植物學(xué)、人類學(xué)、生物物理學(xué));應(yīng)用生物學(xué)(農(nóng)業(yè)生產(chǎn)學(xué)、森林學(xué)、畜產(chǎn)學(xué)、水產(chǎn)學(xué)、食品學(xué)、生物材料科學(xué)、生物資源經(jīng)濟(jì)學(xué)、生命工學(xué))。
9. 醫(yī)療·福祉學(xué)
本科4年，碩士2年，博士3年
內(nèi)容包括：醫(yī)療福祉管理，醫(yī)療福祉經(jīng)營以及臨床心理學(xué)等